Film ini menceritakan karya seorang penulis terkemuka tiba-tiba disensor oleh negara Soviet dan pemutaran perdana drama teatrikalnya tentang Pontius Pilatus dibatalkan. Ia dikeluarkan dari Serikat Penulis Soviet, dan dengan cepat berubah menjadi orang buangan tanpa sarana untuk bertahan hidup. Terinspirasi oleh Margarita – kekasihnya, ia mulai mengerjakan novel baru di mana semua karakter ditafsirkan ulang secara satir dari kehidupannya. Karakter utama novel ini adalah Woland – kekuatan gelap mistis yang mengunjungi Moskow. Hal itu bertujuan untuk membalas dendam semua orang yang menyebabkan kejatuhan penulis. Saat Sang Guru semakin tenggelam dalam novelnya, menambahkan dirinya dan Margarita sebagai karakter. Ia secara bertahap berhenti memperhatikan saat batas antara kenyataan dan imajinasinya memudar.
